Los Laboratorios son organizaciones virtuales del CIMAT, cuyo objetivo es coordinar la integración de las tres actividades sustantivas que desarrolla:
Investigación básica y aplicada, realizada en las área de investigación del CIMAT
Formación de recursos humanos, a través de los programas docentes que se imparten en el CIMAT
Prestación de servicios de asesoría y capacitación en matemáticas, estadística, y computación, canalizados a través de la Dirección de Servicios Tecnológicos
Actualmente el CIMAT cuenta con tres laboratorios, el Laboratorio de Computación (LABCOM), el de Estadística (LABEST), y el de Matemáticas Aplicadas (LABMAP). Cada laboratorio es dirigido por un coordinador, quien convoca y organiza a investigadores de los departamentos académicos del CIMAT, académicos adscritos a la DST, estudiantes de maestría y doctorado especialmente entrenados en labores de investigación y consultoría, así como estudiantes de licenciatura en matemáticas. Los laboratorios concentran gran cantidad de infraestructura física (hardware, software especializado, locales de trabajo, acervo bibliográfico, y redes de comunicación) conducente a la solución a los problemas que le competen. Los laboratorios tienen interés en interactuar con profesionales y problemas surgidos de otras ramas de conocimiento, en un ambiente plenamente interdisciplinario.
Los laboratorios se conciben como el ámbito ideal para la atención de problemas y planteamientos diversos, de la industria, de los sectores social, de gobierno y académico (otras disciplinas) en los que la matemática, la estadística y la computación son potencialmente instrumentales en su solución, ya que funcionan como enlace e integración de las tres actividades sustantivas que se realizan en el CIMAT: investigación, formación, consultoría y capacitación.
Los distintos tipos de interacción entre estas actividades posibilitan que en todo momento:
Los investigadores dispongan de un canal para conocer los problemas vigentes que requieren de asesoría y tengan un conocimiento detallado de los perfiles y disponibilidades de estudiantes para participar en actividades de investigación.
Los estudiantes accedan a las actividades de investigación y de aplicación de la matemática, incidiendo en la riqueza y calidad de su formación.
La DST tenga acceso expedito al aparato de investigación básica y aplicada del CIMAT y a estudiantes en caso necesario.