Estudió el doctorado en Matemáticas en la Universidad de Aarhus, Dinamarca, la maestría en Probabilidad y Estadística en el Centro de Investigaciones en Matemáticas (CIMAT) y la licenciatura en Matemáticas en la Universidad de Guanajuato.

José Ulises se desempeña como Investigador por México en un proyecto asociado a bioinformática. Sus intereses académicos se centran en la creación de modelos estadísticos y estocásticos espacio-temporales que permitan entender fenómenos físicos y biológicos, en las condiciones que dichos modelos deben satisfacer para asegurar que las inferencias realizadas a través de ellos sean reproducibles y en cómo extender dichos modelos a distribuciones más generales. En particular, su investigación actualmente se centra en modelos que surgen en el contexto de la bioestadística y la bioinformática, pero también tiene experiencia en la modelación de otro tipo de fenómenos como la turbulencia.

Actualmente es miembro del Sistema Nacional de Investigadores (SNI) en el Nivel I dentro del Área de Física, Matemáticas y Ciencias de la Tierra.