El área de Ciencias de la Computación del CIMAT está formada por un grupo de expertos en su área de especialidad con trabajos orientados hacia la investigación, la enseñanza, la capacitación y el desarrollo tecnológico. El área cuenta con un programa de Doctorado y Maestría, ambos con el reconocimiento de nivel Internacional en el PNPC, y apoya en las licenciaturas en Computación Matemática y Matemáticas de la Universidad de Guanajuato.

El área cuenta con una extensa red de colaboraciones y visitantes todo el año, y una larga tradición de organizar eventos académicos especializados para investigadores y estudiantes.